1995年4月成立南京师范大学出版社。建社以来,始终坚持“教字当头，以师为本”的办社方针，以“为高校教学科研服务、为文化教育事业服务、为广大教师学生服务”作为矢志不渝的办社宗旨。依托百年名校——南京师范大学的学科优势，办社靠特色、出书重名品，持续挖掘、整合、创新出版资源，在确保以教育理论著作、教材、教师和学生读物为主体的同时，着重围绕素质教育开发重点图书选题，编辑出版有重大价值的学术著作、教材和人文图书。年出版图书500余种、再版400余种。
出版的百余种图书先后在国家新闻出版广电总局、江苏省新闻出版广电局、中国出版协会、中国大学出版社协会等组织的各类图书评比中获近200种奖项。其中，《中国古代民间俗曲曲牌、曲词及曲谱考释》荣获第五届中华优秀出版物奖图书奖，《三礼通论》荣获第二届中国古典整理优秀图书一等奖，《科学少年丛书》《阳光少年书系》《快乐旅程丛书》荣获新闻出版总署向全国青少年推荐百种优秀图书，《幸福的种子》《新手父母教养宝典》《教育实验室丛书•游戏、儿童发展与早期教育》荣获引进版社科类优秀图书奖，《明清苏南望族文化研究》《使者》《魏特琳：忧郁的1937》荣获江苏省精神文明建设“五个一工程”入选作品奖。此外，多次获得各类印制、装帧、数字出版等奖项。
2009年11月，南京师范大学出版社转企改制为南京师范大学出版社有限责任公司，建立了现代出版企业制度。改制后的出版社，通过不断深化改革，进一步完善内部企业治理结构，构建制度化经营管理体系；进一步完善整体绩效考评体系，建立图书选题分类考核机制，以市场和效益为导向建立人员岗位和产品项目的动态调整制度；根据学校学科专业深化改革的各项举措，尤其是教师教育机制改革，主动整合出版资源，加强与各学院的多元化合作，积极为学校文化传承创新提供服务；全力以赴推进学校文化产业园建设，坚持走集团化发展道路；强化并规范合作经营项目，整合校内外资源，做大做强出版传媒产业，提升合作出版品牌价值，培育新的效益增长点，进一步提高核心竞争力；在精品图书出版方面实施“高原造峰计划”，争取获得更多的国家出版大奖；加强人才队伍建设，完善员工职业成长和人才引进培养机制，打造专业化出版团队；加强企业文化建设，构建与南师大精神相匹配的现代企业文化体系。
